El estudio de las zoteas se aborda desde varias perspectivas conceptuales y metodológicas que incluyen la relación con los sistemas tradicionales de producción, el manejo de la agrobiodiversidad, los procesos de apropiación y reconstrucción del territorio, los aportes de la seguridad alimentaria, la economía doméstica y la etnomedicina, las identidades étnicas y de género y la organización comunitaria.